Четыре года прошло после инцидента в «Magical Girl Lyrical Nanoha StrikerS». Вивио выросла и посещает Академию магии, надеясь стать такой же сильной и хорошей волшебницей, как и её мама. Этому вполне содействует полученное ею наконец устройство «Sacred Heart». Но, конечно же, не всё так сладко, и спокойствие в королевстве длиться не долго...